Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hps3Q91VB4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hps3Q91VB4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hps3Q91VB4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Hps3Q91VB4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hps3Q91VB4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Hps3Q91VB4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hps3Q91VB4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hps3Q91VB4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hps3Q91VB4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hps3Q91VB4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hps3Q91VB4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hps3Q91VB4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hps3Q91VB4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hps3Q91VB4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Hps3Q91VB4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hps3Q91VB4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms