Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ppargc1bQ8VHJ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ppargc1bQ8VHJ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms