Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt25Q8VCW2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt25Q8VCW2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Krt25Q8VCW2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Krt25Q8VCW2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Krt25Q8VCW2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Krt25Q8VCW2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Krt25Q8VCW2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Krt25Q8VCW2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Krt25Q8VCW2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Krt25Q8VCW2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Krt25Q8VCW2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Krt25Q8VCW2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms