Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2P1

Klhl25, Kelch-like protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl25Q8R2P1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl25Q8R2P1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl25Q8R2P1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl25Q8R2P1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl25Q8R2P1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl25Q8R2P1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl25Q8R2P1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl25Q8R2P1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl25Q8R2P1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl25Q8R2P1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl25Q8R2P1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl25Q8R2P1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms