Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg10Q8R1P4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg10Q8R1P4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg10Q8R1P4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg10Q8R1P4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg10Q8R1P4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg10Q8R1P4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg10Q8R1P4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg10Q8R1P4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg10Q8R1P4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms