Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cdk5rap2Q8K389 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cdk5rap2Q8K389 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdk5rap2Q8K389 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cdk5rap2Q8K389 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk5rap2Q8K389 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk5rap2Q8K389 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk5rap2Q8K389 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk5rap2Q8K389 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk5rap2Q8K389 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdk5rap2Q8K389 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cdk5rap2Q8K389 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Cdk5rap2Q8K389 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cdk5rap2Q8K389 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cdk5rap2Q8K389 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cdk5rap2Q8K389 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cdk5rap2Q8K389 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cdk5rap2Q8K389 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cdk5rap2Q8K389 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cdk5rap2Q8K389 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cdk5rap2Q8K389 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cdk5rap2Q8K389 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Cdk5rap2Q8K389 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cdk5rap2Q8K389 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cdk5rap2Q8K389 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Cdk5rap2Q8K389 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cdk5rap2Q8K389 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cdk5rap2Q8K389 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cdk5rap2Q8K389 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cdk5rap2Q8K389 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cdk5rap2Q8K389 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cdk5rap2Q8K389 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cdk5rap2Q8K389 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cdk5rap2Q8K389 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Cdk5rap2Q8K389 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cdk5rap2Q8K389 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cdk5rap2Q8K389 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cdk5rap2Q8K389 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cdk5rap2Q8K389 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Cdk5rap2Q8K389 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cdk5rap2Q8K389 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
Cdk5rap2Q8K389 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms