Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scara5Q8K299 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scara5Q8K299 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scara5Q8K299 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scara5Q8K299 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms