Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alkbh3Q8K1E6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alkbh3Q8K1E6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alkbh3Q8K1E6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alkbh3Q8K1E6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Alkbh3Q8K1E6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Alkbh3Q8K1E6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Alkbh3Q8K1E6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh3Q8K1E6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms