Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FgbQ8K0E8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FgbQ8K0E8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FgbQ8K0E8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FgbQ8K0E8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FgbQ8K0E8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms