Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpne5Q8JZW4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpne5Q8JZW4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne5Q8JZW4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cpne5Q8JZW4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne5Q8JZW4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne5Q8JZW4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne5Q8JZW4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne5Q8JZW4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne5Q8JZW4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne5Q8JZW4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne5Q8JZW4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne5Q8JZW4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne5Q8JZW4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne5Q8JZW4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne5Q8JZW4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne5Q8JZW4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms