Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc4a8Q8JZR6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc4a8Q8JZR6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc4a8Q8JZR6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc4a8Q8JZR6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slc4a8Q8JZR6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms