Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rasgef1bQ8JZL7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rasgef1bQ8JZL7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms