Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mterf1aQ8CHZ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mterf1aQ8CHZ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mterf1aQ8CHZ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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