Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rab11fip3Q8CHD8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rab11fip3Q8CHD8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rab11fip3Q8CHD8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rab11fip3Q8CHD8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rab11fip3Q8CHD8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rab11fip3Q8CHD8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rab11fip3Q8CHD8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rab11fip3Q8CHD8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
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