Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr2bQ8CFI7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2bQ8CFI7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2bQ8CFI7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms