Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFG9

C1rb, Complement C1r-B subcomponent, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1rbQ8CFG9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1rbQ8CFG9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1rbQ8CFG9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1rbQ8CFG9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1rbQ8CFG9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1rbQ8CFG9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1rbQ8CFG9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1rbQ8CFG9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1rbQ8CFG9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1rbQ8CFG9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1rbQ8CFG9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1rbQ8CFG9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1rbQ8CFG9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1rbQ8CFG9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1rbQ8CFG9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1rbQ8CFG9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms