Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ9

4932414N04Rik, RIKEN cDNA 4932414N04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932414N04RikQ8CEQ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4932414N04RikQ8CEQ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4932414N04RikQ8CEQ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4932414N04RikQ8CEQ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4932414N04RikQ8CEQ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
4932414N04RikQ8CEQ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4932414N04RikQ8CEQ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4932414N04RikQ8CEQ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4932414N04RikQ8CEQ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4932414N04RikQ8CEQ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4932414N04RikQ8CEQ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms