Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC21

Ttc19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc19Q8CC21 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttc19Q8CC21 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttc19Q8CC21 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc19Q8CC21 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc19Q8CC21 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc19Q8CC21 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc19Q8CC21 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc19Q8CC21 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc19Q8CC21 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc19Q8CC21 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc19Q8CC21 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc19Q8CC21 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc19Q8CC21 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc19Q8CC21 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc19Q8CC21 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc19Q8CC21 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ttc19Q8CC21 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ttc19Q8CC21 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttc19Q8CC21 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttc19Q8CC21 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttc19Q8CC21 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttc19Q8CC21 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttc19Q8CC21 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttc19Q8CC21 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ttc19Q8CC21 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc19Q8CC21 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc19Q8CC21 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc19Q8CC21 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc19Q8CC21 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc19Q8CC21 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc19Q8CC21 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms