Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nrip1Q8CBD1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrip1Q8CBD1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nrip1Q8CBD1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nrip1Q8CBD1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nrip1Q8CBD1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrip1Q8CBD1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrip1Q8CBD1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrip1Q8CBD1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrip1Q8CBD1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrip1Q8CBD1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrip1Q8CBD1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrip1Q8CBD1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrip1Q8CBD1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nrip1Q8CBD1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nrip1Q8CBD1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nrip1Q8CBD1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nrip1Q8CBD1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nrip1Q8CBD1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nrip1Q8CBD1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nrip1Q8CBD1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nrip1Q8CBD1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nrip1Q8CBD1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nrip1Q8CBD1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrip1Q8CBD1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrip1Q8CBD1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrip1Q8CBD1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nrip1Q8CBD1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nrip1Q8CBD1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nrip1Q8CBD1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nrip1Q8CBD1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nrip1Q8CBD1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nrip1Q8CBD1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nrip1Q8CBD1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nrip1Q8CBD1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nrip1Q8CBD1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrip1Q8CBD1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrip1Q8CBD1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrip1Q8CBD1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrip1Q8CBD1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nrip1Q8CBD1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nrip1Q8CBD1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nrip1Q8CBD1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nrip1Q8CBD1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrip1Q8CBD1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms