Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9H6

Strip2, Striatin-interacting proteins 2, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip2Q8C9H6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strip2Q8C9H6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Strip2Q8C9H6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Strip2Q8C9H6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Strip2Q8C9H6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms