Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc159Q8C963 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc159Q8C963 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc159Q8C963 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc159Q8C963 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc159Q8C963 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc159Q8C963 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc159Q8C963 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc159Q8C963 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc159Q8C963 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc159Q8C963 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc159Q8C963 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc159Q8C963 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc159Q8C963 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc159Q8C963 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc159Q8C963 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc159Q8C963 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc159Q8C963 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc159Q8C963 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms