Protein–RNA interactions for Protein: Q8C494

Prr33, Proline-rich protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr33Q8C494 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr33Q8C494 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr33Q8C494 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr33Q8C494 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr33Q8C494 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr33Q8C494 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr33Q8C494 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms