Protein–RNA interactions for Protein: Q8C494

Prr33, Proline-rich protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr33Q8C494 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr33Q8C494 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr33Q8C494 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr33Q8C494 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr33Q8C494 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr33Q8C494 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr33Q8C494 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr33Q8C494 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr33Q8C494 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr33Q8C494 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms