Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C3W1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C3W1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8C3W1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8C3W1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8C3W1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C3W1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C3W1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q8C3W1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q8C3W1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8C3W1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8C3W1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8C3W1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8C3W1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8C3W1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8C3W1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8C3W1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8C3W1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms