Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TiparpQ8C1B2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TiparpQ8C1B2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TiparpQ8C1B2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TiparpQ8C1B2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TiparpQ8C1B2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms