Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgef5Q8C0Q9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgef5Q8C0Q9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgef5Q8C0Q9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgef5Q8C0Q9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgef5Q8C0Q9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rapgef5Q8C0Q9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rapgef5Q8C0Q9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rapgef5Q8C0Q9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rapgef5Q8C0Q9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef5Q8C0Q9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef5Q8C0Q9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef5Q8C0Q9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef5Q8C0Q9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef5Q8C0Q9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef5Q8C0Q9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rapgef5Q8C0Q9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rapgef5Q8C0Q9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rapgef5Q8C0Q9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef5Q8C0Q9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef5Q8C0Q9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef5Q8C0Q9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef5Q8C0Q9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef5Q8C0Q9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rapgef5Q8C0Q9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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