Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim35Q8C006 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim35Q8C006 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim35Q8C006 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim35Q8C006 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim35Q8C006 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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