Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl38Q8BSF5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl38Q8BSF5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl38Q8BSF5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms