Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQN9

C030005K15Rik, RIKEN cDNA C030005K15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C030005K15RikQ8BQN9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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C030005K15RikQ8BQN9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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C030005K15RikQ8BQN9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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C030005K15RikQ8BQN9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C030005K15RikQ8BQN9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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C030005K15RikQ8BQN9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C030005K15RikQ8BQN9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C030005K15RikQ8BQN9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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C030005K15RikQ8BQN9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C030005K15RikQ8BQN9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C030005K15RikQ8BQN9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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C030005K15RikQ8BQN9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C030005K15RikQ8BQN9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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C030005K15RikQ8BQN9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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C030005K15RikQ8BQN9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C030005K15RikQ8BQN9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C030005K15RikQ8BQN9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C030005K15RikQ8BQN9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C030005K15RikQ8BQN9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C030005K15RikQ8BQN9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C030005K15RikQ8BQN9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C030005K15RikQ8BQN9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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C030005K15RikQ8BQN9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C030005K15RikQ8BQN9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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