Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpc2Q8BKV1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpc2Q8BKV1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpc2Q8BKV1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpc2Q8BKV1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpc2Q8BKV1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gpc2Q8BKV1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gpc2Q8BKV1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpc2Q8BKV1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpc2Q8BKV1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpc2Q8BKV1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpc2Q8BKV1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpc2Q8BKV1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpc2Q8BKV1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gpc2Q8BKV1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gpc2Q8BKV1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpc2Q8BKV1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpc2Q8BKV1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms