Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK06

Fbxo9, F-box only protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo9Q8BK06 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo9Q8BK06 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo9Q8BK06 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fbxo9Q8BK06 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo9Q8BK06 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo9Q8BK06 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo9Q8BK06 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo9Q8BK06 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms