Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe23Q8BGW3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bhlhe23Q8BGW3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms