Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrtm2Q8BGA3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrtm2Q8BGA3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrtm2Q8BGA3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms