Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms