Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc50Q810U5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc50Q810U5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc50Q810U5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc50Q810U5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms