Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Tmem39bQ810L4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmem39bQ810L4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmem39bQ810L4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmem39bQ810L4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmem39bQ810L4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmem39bQ810L4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmem39bQ810L4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmem39bQ810L4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmem39bQ810L4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmem39bQ810L4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem39bQ810L4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem39bQ810L4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem39bQ810L4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem39bQ810L4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem39bQ810L4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem39bQ810L4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem39bQ810L4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Tmem39bQ810L4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmem39bQ810L4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmem39bQ810L4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmem39bQ810L4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmem39bQ810L4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmem39bQ810L4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmem39bQ810L4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmem39bQ810L4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmem39bQ810L4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem39bQ810L4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmem39bQ810L4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmem39bQ810L4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmem39bQ810L4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmem39bQ810L4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmem39bQ810L4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms