Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrde2Q80XC6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nrde2Q80XC6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nrde2Q80XC6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nrde2Q80XC6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms