Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SnphQ80U23 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnphQ80U23 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnphQ80U23 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms