Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Klhl29Q80T74 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl29Q80T74 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl29Q80T74 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl29Q80T74 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms