Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim17Q7TPM3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim17Q7TPM3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim17Q7TPM3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim17Q7TPM3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim17Q7TPM3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms