Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc6aQ78XR0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc6aQ78XR0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc6aQ78XR0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc6aQ78XR0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc6aQ78XR0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc6aQ78XR0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc6aQ78XR0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trappc6aQ78XR0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc6aQ78XR0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trappc6aQ78XR0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc6aQ78XR0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc6aQ78XR0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc6aQ78XR0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc6aQ78XR0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc6aQ78XR0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc6aQ78XR0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc6aQ78XR0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc6aQ78XR0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc6aQ78XR0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc6aQ78XR0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc6aQ78XR0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc6aQ78XR0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc6aQ78XR0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc6aQ78XR0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc6aQ78XR0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc6aQ78XR0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc6aQ78XR0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc6aQ78XR0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc6aQ78XR0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc6aQ78XR0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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