Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnih3Q6ZWS4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnih3Q6ZWS4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnih3Q6ZWS4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnih3Q6ZWS4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms