Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Ncapd3Q6ZQK0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ncapd3Q6ZQK0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Ncapd3Q6ZQK0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ncapd3Q6ZQK0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ncapd3Q6ZQK0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Ncapd3Q6ZQK0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Ncapd3Q6ZQK0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ncapd3Q6ZQK0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ncapd3Q6ZQK0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ncapd3Q6ZQK0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ncapd3Q6ZQK0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ncapd3Q6ZQK0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ncapd3Q6ZQK0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ncapd3Q6ZQK0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ncapd3Q6ZQK0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ncapd3Q6ZQK0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ncapd3Q6ZQK0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Ncapd3Q6ZQK0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ncapd3Q6ZQK0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ncapd3Q6ZQK0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ncapd3Q6ZQK0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms