Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf653Q6YND2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf653Q6YND2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf653Q6YND2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf653Q6YND2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf653Q6YND2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf653Q6YND2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf653Q6YND2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf653Q6YND2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf653Q6YND2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf653Q6YND2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf653Q6YND2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf653Q6YND2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf653Q6YND2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Znf653Q6YND2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf653Q6YND2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf653Q6YND2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf653Q6YND2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf653Q6YND2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf653Q6YND2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf653Q6YND2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf653Q6YND2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf653Q6YND2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf653Q6YND2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf653Q6YND2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf653Q6YND2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf653Q6YND2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms