Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2eQ6VUP9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2eQ6VUP9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tfap2eQ6VUP9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms