Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Casc1Q6TDU8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casc1Q6TDU8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Casc1Q6TDU8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Casc1Q6TDU8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Casc1Q6TDU8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Casc1Q6TDU8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Casc1Q6TDU8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Casc1Q6TDU8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Casc1Q6TDU8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Casc1Q6TDU8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Casc1Q6TDU8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Casc1Q6TDU8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Casc1Q6TDU8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Casc1Q6TDU8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Casc1Q6TDU8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Casc1Q6TDU8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Casc1Q6TDU8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms