Protein–RNA interactions for Protein: Q6T707

Scd4, Acyl-CoA desaturase 4, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd4Q6T707 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Scd4Q6T707 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scd4Q6T707 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scd4Q6T707 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scd4Q6T707 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.8 ms