Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HjurpQ6PG16 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HjurpQ6PG16 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HjurpQ6PG16 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HjurpQ6PG16 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HjurpQ6PG16 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HjurpQ6PG16 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HjurpQ6PG16 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HjurpQ6PG16 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HjurpQ6PG16 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HjurpQ6PG16 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HjurpQ6PG16 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HjurpQ6PG16 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HjurpQ6PG16 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HjurpQ6PG16 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HjurpQ6PG16 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HjurpQ6PG16 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HjurpQ6PG16 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HjurpQ6PG16 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.5 ms