Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Taf1cQ6PDZ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf1cQ6PDZ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1cQ6PDZ2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1cQ6PDZ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms