Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ecm29Q6PDI5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm29Q6PDI5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm29Q6PDI5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm29Q6PDI5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm29Q6PDI5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm29Q6PDI5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm29Q6PDI5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ecm29Q6PDI5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ecm29Q6PDI5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ecm29Q6PDI5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ecm29Q6PDI5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ecm29Q6PDI5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ecm29Q6PDI5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ecm29Q6PDI5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ecm29Q6PDI5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ecm29Q6PDI5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ecm29Q6PDI5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ecm29Q6PDI5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ecm29Q6PDI5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ecm29Q6PDI5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ecm29Q6PDI5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ecm29Q6PDI5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ecm29Q6PDI5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ecm29Q6PDI5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ecm29Q6PDI5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ecm29Q6PDI5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ecm29Q6PDI5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ecm29Q6PDI5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ecm29Q6PDI5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Ecm29Q6PDI5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ecm29Q6PDI5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ecm29Q6PDI5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ecm29Q6PDI5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ecm29Q6PDI5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ecm29Q6PDI5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ecm29Q6PDI5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ecm29Q6PDI5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ecm29Q6PDI5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ecm29Q6PDI5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ecm29Q6PDI5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ecm29Q6PDI5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ecm29Q6PDI5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ecm29Q6PDI5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms