Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Gapvd1Q6PAR5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Gapvd1Q6PAR5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Gapvd1Q6PAR5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Gapvd1Q6PAR5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Gapvd1Q6PAR5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Gapvd1Q6PAR5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Gapvd1Q6PAR5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Gapvd1Q6PAR5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Gapvd1Q6PAR5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Gapvd1Q6PAR5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Gapvd1Q6PAR5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Gapvd1Q6PAR5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Gapvd1Q6PAR5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Gapvd1Q6PAR5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Gapvd1Q6PAR5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Gapvd1Q6PAR5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Gapvd1Q6PAR5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Gapvd1Q6PAR5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
Gapvd1Q6PAR5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Gapvd1Q6PAR5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Gapvd1Q6PAR5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Gapvd1Q6PAR5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Gapvd1Q6PAR5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Gapvd1Q6PAR5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Gapvd1Q6PAR5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Gapvd1Q6PAR5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Gapvd1Q6PAR5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Gapvd1Q6PAR5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Gapvd1Q6PAR5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Gapvd1Q6PAR5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Gapvd1Q6PAR5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Gapvd1Q6PAR5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Gapvd1Q6PAR5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Gapvd1Q6PAR5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Gapvd1Q6PAR5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Gapvd1Q6PAR5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Gapvd1Q6PAR5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Gapvd1Q6PAR5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Gapvd1Q6PAR5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Gapvd1Q6PAR5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Gapvd1Q6PAR5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Gapvd1Q6PAR5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Gapvd1Q6PAR5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Gapvd1Q6PAR5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Gapvd1Q6PAR5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Gapvd1Q6PAR5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Gapvd1Q6PAR5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Gapvd1Q6PAR5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Gapvd1Q6PAR5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Gapvd1Q6PAR5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Gapvd1Q6PAR5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Gapvd1Q6PAR5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Gapvd1Q6PAR5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Gapvd1Q6PAR5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Gapvd1Q6PAR5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Gapvd1Q6PAR5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Gapvd1Q6PAR5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Gapvd1Q6PAR5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Gapvd1Q6PAR5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Gapvd1Q6PAR5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Gapvd1Q6PAR5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Gapvd1Q6PAR5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms